在李轨的指挥下，军队连连获胜，于大业十三年（公元年），李轨自称河西大凉王，次年（公元年），李轨正式称帝，史称大凉政权。金城薛举见自己地盘出现个李轨，心里很不爽，带着大队人马去攻打，结果让派兵阻击在昌松（今古浪县）全歼薛举之兵，摆平薛举后，河西五郡尽归大凉政权。

当了皇帝后，李轨飘了，开始追求自身享受，听信巫婆胡言乱语，大量征术筑玉女台，修炼长生不老之术，花费很大。在称帝的第二年，凉州又遭旱灾，饿殍遍野，甚至到了人吃人的地步。但是手底下的百姓吃不上饭，也不能不管，于是召开会议。心怀慈悲的大臣说：“眼下百姓有难，如果朝廷体恤百姓，他们必然感恩戴德，我们的统治才能巩固。”那些自私的官员说：“老百姓没有价值，还不如把粮食省下来给军队，他们能帮你打江山，老百姓能给你什么。”最后李轨轻自私官员的话，封仓停赈，致使朝野内外，人心背离，也成为后来失败的原因。

在旱灾发生的第二年，李渊就打到这个地方，由于李轨手下的安修仁与在长安为官的安兴贵系亲兄弟，所以安兴贵对李轨政权的内部情况了如指掌，主动向李渊提出出使凉州说降李轨。等安兴贵到凉州，安兴贵劝说李轨顺应潮流，归附唐朝，李轨非但不接受，还臭骂了安兴贵一顿。

见劝说无效，安兴贵与安修仁密谋打算以武力解决。安修仁知道上次旱灾李轨就失去了民心，只要在百姓中做好思想工作，就能轻易抓到李轨。

当夜，安氏兄弟发动少数民族兵马和百姓包围了凉州城。李轨被迫率兵出战，败入城中，登上城头观望，安兴贵大声喊道：“大唐使我来擒李轨，不从者诛三族！”李轨一看大势已去，便携带妻子登上玉女台欲自尽，安修仁冲上玉女台擒获李轨。

李轨从起兵到被杀，前后不到三年，就政权倾覆，有自身能力不足，也有失去百姓支持，在李轨被俘的时候，仰天长叹：“人心已失，天亡我也。”